Дело Елькина рассматривалось на выездном заседании Верховного суда Дагестана в столице Карачаево-Черкесии Черкесске. Он был признан виновным по статье УК РФ «вооруженный мятеж» и оправдан по ряду других статей.
В ходе следствия было установлено, что в мае 1999 года Елькин умышленно с целью обучения военному делу и получения идеологической подготовки экстремистского толка выехал из Карачаевска в Урус-Мартан Чеченской Республики, и добровольно вступил в состав незаконного вооруженного формирования, действовавшего под руководством полевого командира Магомедова, известного как Багаутдин Дагестани.
После этого в составе отряда Багаутдина Магомедова в конце июля 1999 года Елькин принял активное участие в вооруженном мятеже на территории Цумадинского района в целях свержения конституционного строя и нарушения территориальной целостности Российской Федерации. В ходе вооруженного мятежа он участвовал в насильственном роспуске действовавших законных органов госвласти, захвате семи населенных пунктов, убийстве двух работников милиции и одного военнослужащего, захвате трех милиционеров в заложники. В зоне военных действий были полностью разрушены дороги, объекты здравоохранения, школы, административные и производственные помещения. Общий ущерб, нанесенный инфраструктуре района, составил более 36 млн рублей.
После событий 1999 года Елькин проживал в Карачаево-Черкесии.
Уголовное дело в отношении Елькина было возбуждено в сентябре 2011 года УФСБ России по Карачаево-Черкесии после получения оперативной информации о его участии в нападении на Дагестан.