Нападение было совершено около 07.00 в пригороде Махачкалы, в посёлке Семендер, где жил журналист. Автомобиль журналиста обстреляли в 50 метрах от его дома. Ахмеднабиев погиб на месте.
Возбуждено уголовное дело по трем статьям УК РФ: 105 (убийство), 167 (умышленное повреждение имущества) и 222 (незаконный оборот оружия). Рассматривается несколько версий, приоритетная – убийство связано со служебной деятельностью Ахмеднабиева.
В мае 2012 года Ахмеднаби Ахмеднабиев заявлял об угрозах в его адрес. А 11 января 2013 года неизвестные произвели три выстрела в Ахмеднабиева, но тогда он не пострадал. По данному факту было возбуждено уголовное дело по ч.1 ст.167 «Умышленные уничтожение или повреждение имущества» и ч. 1 ст.222 «Незаконные приобретение, передача, сбыт, хранение, перевозка или ношение оружия» УК РФ.
Имя Ахмеднаби Ахмеднабиева фигурировало в «расстрельном списке», распространенном в сентябре 2009 года по Махачкале, в которых анонимные авторы обещали целенаправленно мстить за сотрудников милиции и мирных граждан. В этот список попали известные в Дагестане адвокаты, журналисты и правозащитники – всего 16 человек.
Врио Президента Дагестана Рамазан Абдулатипов взял под свой контроль расследование убийства журналиста Ахмеднаби Ахмеднабиева. Глава республики получил информацию об уголовном деле и дал поручения руководителям правоохранительных органов.