Евразийская ассоциация университетов была создана на Учредительном съезде в 1989 году как Ассоциация университетов СССР по инициативе Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова. Инициатива была поддержана двадцатью крупнейшими университетами Советского Союза. В 1992 году ассоциация была преобразована в Евразийскую ассоциацию университетов.
Сегодня Евразийская ассоциация университетов является авторитетной и влиятельной международной организацией университетов. В нее входят национальные университеты всех стран СНГ, ведущие региональные университеты и вузы стран Евразийского пространства.
Высшим руководящим органом Евразийской ассоциации является Съезд ассоциации. В период между Съездами руководство Ассоциацией осуществляется Советом и Исполнительным комитетом. Президентом Евразийской ассоциации университетов является ректор МГУ Виктор Садовничий.
Вместе с Муртазали Рабадановым в состав Совета Ассоциации вошли еще 28 ректоров ведущих университетов стран СНГ. Состав остается неизменным в течение пяти лет.
